Wybrano nowego prokuratora okręgowego Gotham. Nazywa się Harvey Dent i ma radykalnie nowy plan, który grozi zniszczeniem podziemia przestępczości zorganizowanej Gotham raz na zawsze żelazną pięścią. Jednak pojawienie się nieuczciwego strażnika, znanego jako Batman, spowodowało problemy dla Denta i jego planów. Przybył nowy kryminalny geniusz znany tylko jako „Joker”, którego celem jest wyciągnięcie Gotham spod żelaznej pięści Harveya Denta. Joker organizuje mistrzowsko zaplanowany napad na bank i okrada tłum z Gotham. Wykorzystuje te pieniądze do przeprowadzenia serii przerażających i strategicznych ataków na miasto i jego mieszkańców, z których każdy jest starannie zaplanowany i wycelowany w Denta i Batmana, jednocześnie powodując, że reszta miasta wpada w panikę. Tymczasem Batman myśli, że mógł znaleźć trop do Jokera dzięki kontaktom Wayne Enterprises z podejrzanym chińskim bankierem, co zabiera Batmana i Alfreda do Hongkongu. Joker nie ma żadnych zasad, ale Batman ma tylko jedną, a Joker ma na celu zmuszenie Batmana do złamania jego jedynej zasady. Ale kto będzie tym, który go zabije, czy będzie to nieuczciwy Vigilante Batman, czy zostanie wybrany oficjalnym Harveyem Dentem, nowym bohaterem z twarzą?

Osiem lat po wydarzeniach z Mrocznego Rycerza (2008) odnajduje Gotham w czasie pokoju. Jest to spowodowane tym, że Batman wziął się za morderstwo Harveya Denta. Jednak nowa siła zła o imieniu Bane przybyła do Gotham i ma na celu przejęcie miasta i ujawnienie prawdy o tym, kim naprawdę był Harvey Dent. Teraz, gdy Wayne Manor został całkowicie przebudowany, Bruce Wayne stał się niemal samotnikiem, rzadko opuszczając posiadłość. A gdy Bane przejmuje miasto siłą, zmusza Batmana do wyjścia z emerytury. Ale jego sojusznicy są bardzo nieliczni. Nieuchwytna złodziejka klejnotów o imieniu Selina Kyle może być kluczem do powstrzymania Bane'a, ale po czyjej stronie jest?

Nadchodzi wybawienie dla Gotham. Mroczny Rycerz oraz jego prawa ręka, młoda i odważna Carrie Kelly - Robin, ostatecznie odzyskują Gotham i rozniecają iskierkę nadziei wśród mieszkańców terroryzowanego przez Mutanty miasta. Gdy Batman ponownie pojawia się na horyzoncie, szukające sensacji media budzą największe zło Azylu Arkham - Jokera! Ten odwieczny wróg człowieka-nietoperza uknuł diaboliczny plan, który może doprowadzić do obłędu Mrocznego Rycerza.