W angielskiej Krainie Jezior Peter Rabbit, jego kuzyn Benjamin Bunny i trojaczki Petera Flopsy, Mopsy i Cottontail spędzają większość swoich dni na czepianiu się pana Joe McGregora i kradnięciu warzyw z jego ogrodu. Zaprzyjaźniają się z miejscową kobietą o imieniu Bea, która spędza czas na malowaniu obrazów królików i otaczającej ich przyrody. Bea nawiązuje matczyne relacje z królikami z powodu śmierci ich rodziców, których zabił McGregor. Pewnego dnia Peter zostaje zmuszony do pozostawienia kurtki w ogrodzie McGregora i wraca, by ją odzyskać. McGregor dostrzega go i łapie, ale nagle umiera na atak serca z powodu dziesięcioleci niezdrowych nawyków żywieniowych. Zafascynowany Peter zaprasza wszystkie lokalne zwierzęta i przejmuje posiadłość McGregora.

Bea Thomas i króliki stworzyli prowizoryczną rodzinę. I choć Piotruś Królik bardzo się starał, nie udało mu się pozbyć złej reputacji złośliwca. Kiedy Piotruś Królik ucieka z ogrodu, odkrywa, że jego złośliwość pomaga mu przetrwać w obcym świecie, ale kiedy zobaczy, że jego rodzina ryzykuje wszystkim, by go odnaleźć, będzie musiał podjąć decyzję: jakim króliczkiem chce być.